例えば、ndn-cxxを利用して書いたhoge.cppというファイルをコンパイルして実行する場合、hoge.cppをexamples/下に置いて

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$ ./waf configure --with-examples #以前configureしてある方は省略
$ ./waf
$ ./build/exsamples/hoge

として実行していたものが、更新したら実行出来なくなっていて、
色々探した結果

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$ ./examples/hoge

とやって実行するように仕様が変更されていた……
せめてREADMEには書いておいてくれよ…..